无尽的拉格朗日中的舰船设计以模块化定制为核心特色，每艘战舰的武器系统、装甲系统、动力系统等均可独立改造。游戏内舰船蓝图通常包含5-7个可改装配件系统，玩家可通过技术值对舰船各模块进行针对性强化，例如提升武器伤害与命中率、增强装甲结构值与伤害抵抗能力，或优化动力系统的曲率速度。这种深度定制化设计使得同型号舰船因玩家策略不同而产生性能分化，为战斗配置提供了高度自由度。舰船强化所需技术值主要通过战斗经验、蓝图研究及商店购买获取，技术值的分配策略直接影响舰船在战场中的定位与表现。
舰船类型采用分层设计理念，从护卫舰到航空母舰共分八大类，每类舰船具有明确的职能划分与人口占用规则。工程舰与战斗舰采用独立人口计算机制，工程舰专注于资源采集效率，其仓储系统与开采速度可通过技术值强化；战斗舰则按护卫舰、驱逐舰等层级递进，高阶舰种需解锁对应基地等级才能生产。舰船属性数据包含火力、耐久、曲率速度等11项参数，其中曲率速度直接影响舰队行军效率，是偷袭与包夹战术的关键因素。舰船子型号系统进一步丰富了战斗多样性，如FG300护卫舰分为装甲型、侦查型等变体，通过不同强化方向适应多元战场需求。
武器调校系统采用保底机制强化舰船战力，玩家可通过消耗武器技术模块提升武器伤害，每20次调校必定成功。联络站每日提供的技术购买机会与战斗掉落的技术模块，共同构成了武器强化的主要资源渠道。特殊舰种如载机型战舰拥有专属的维护指挥系统强化项，可提升载机伤害、锁定速度等参数，而维修舰的维护系统则强化维修量与冷却效率。这种分类型、分阶段的强化体系，确保了各类舰船在后期仍能通过持续投入保持竞争力。
舰船移动速度的差异化设计深刻影响战术执行。游戏将舰船速度划分为龟速型（250）、慢速型（400-500）、普通型（650）及高速型（800+）四档，舰队整体速度由最慢单位决定。该机制促使玩家在编组时需权衡火力与机动性，例如高速护卫舰适合组建骚扰部队，而低速战列舰则需依赖提前部署。包夹战术的伤害机制设计独具特色，包夹舰队可无视敌方阵型直接攻击中后排单位，这使得移动速度成为战术执行的核心变量。舰船设计通过速度层级的明确划分，实现了战略地图上的动态博弈空间。
舰船等级共享机制与技术点分配策略构成了成长体系的双重维度。同种舰船及其子型号共享等级，升级获得的通用技术点可自由分配至不同模块。经验获取途径包含战斗结算、模拟战斗数据及蓝图研究，其中模拟战斗数据按舰种分类使用，强化了培养的针对性。载机型舰船通过强化机库系统可显著提升载机性能，而攻城类舰船则需平衡对舰火力与攻城数值。这种成长体系既保留了单舰培养的深度，又通过类型克制与职能分工确保了舰队组合的战略意义。
