秘传技能是推进剧情和探索地图的关键道具，共包含七种技能。这些技能需要通过特定剧情或NPC互动获取，且多数需要满足前置条件才能触发。秘传技能无法通过升级或商店购买获得，必须按照游戏流程逐步解锁。掌握所有秘传技能后，玩家将能完全探索游戏世界，包括之前无法到达的隐藏区域。
第一个获取的秘传技能通常是一字斩，玩家需要在圣安努号游轮帮助船长后获得。这艘游轮停靠在枯叶市港口，登船后需完成一系列剧情任务才能进入船长室。飞天技能则位于彩虹市左侧的小屋内，与女孩对话即可取得，但需要先使用一字斩砍开挡路的树木。冲浪技能藏在野生原野区深处，需要耐心探索该区域的复杂地形才能找到。野生原野区有步数限制，建议提前规划路线。
怪力技能的获取过程较为特殊，玩家需在浅红市的狩猎区找到园长的假牙，将其归还后才能获得该技能。碎岩技能需要前往一之岛的温泉洞穴，与那里的老人对话取得。攀瀑技能则位于四之岛的某个洞窟深处，这是后期才能到达的区域。闪光技能在收服10种以上宝可梦后，可在地鼠洞出口附近的研究员处获得，主要用于照亮黑暗的洞穴。
每种秘传技能都有对应的使用场景和教学限制。一字斩用于清除小树障碍，飞天可快速返回已访问的城镇，冲浪用于水上移动，怪力能推动巨石，碎岩可破坏特定岩石，闪光照亮黑暗洞穴，攀瀑则用于攀登瀑布。需火红版本没有潜水秘传技能，这是与其他版本的区别之一。建议在获得新秘传技能后立即让合适的宝可梦学习，以便继续推进剧情。
秘传技能的获取顺序基本遵循游戏进程设计，建议按照剧情发展逐步收集。部分技能如冲浪和攀瀑涉及后期内容，不必过早强求。所有秘传技能都具有永久性，一旦获得就不会丢失。如果遇到无法推进的情况，可以检查是否遗漏了某个秘传技能的获取，或者需要先完成其他主线任务。合理利用这些技能将大大提升游戏体验和探索效率。
